Van grote waarde is het wetenschappelijk onderzoek naar spierziekten en bewegingsstoornissen dat door het Prinses Beatrix Fonds wordt gesubsidieerd. Jaarlijks kunnen zo'n 8-10 onderzoeken worden begonnen, vaak voor de duur van twee tot vier jaar.

Daarnaast is samenwerking en communicatie tussen wetenschappers, clinici en patiëntenorganisaties van belang om onderzoeksresultaten op elkaar af te stemmen en te vertalen naar klinische trials en nieuwe behandelingen. Het Prinses Beatrix Fonds stimuleert dit door financiering van en/of deelname in een aantal platforms en initiatieven.